AG Escher
EU/ Land Berlin fördern Forschungsverbund*: Entwicklung eines mNGS/3GS-basierten Diagnostiksystems zum Nachweis pathophysiologischer Mechanismen von klinischer Relevanz bei Erreger-induzierten, entzündlichen Herzmuskelerkrankungen als Grundlage zur Etablierung spezifischer, kausaler und personalisierter therapeutischer Ansätze - VIRus detection in the heart by Next-Generation Sequencing (ViRGiS) 2.0 (Projektdauer 2023-2025)
(*Pro FIT: Programm zur Förderung von Forschung, Innovationen und Technologien, Projektträger: Land Berlin, Senatsverwaltung für Wirtschaft, Energie und Betriebe, über die IBB)
Das Wachstum der Weltbevölkerung, eine fortschreitende Erderwärmung und die zunehmende globale Mobilität fördern die weltweite Verbreitung von Infektionserkrankungen. Ein umfassender und exakter Erregernachweis ist von essentieller Bedeutung für Patientinnen und Patienten mit unklarer Herzinsuffizienz, da eine Persistenz sowohl von Virus als auch von Entzündungsreaktionen im Herzen mit einer verschlechterten Prognose einhergeht.
Die EU (Europäischer Fonds für regionale Entwicklung, EFRE) und das Land Berlin / IBB fördern ein Forschungsvorhaben der Kooperationspartner Deutsches Herzzentrum der Charité (Abt. für Kardiologie, Angiologie und Intensivmedizin CVK, PI: PD. Dr. Felicitas Escher), Robert Koch Institut und des Instituts für Kardiale Diagnostik und Therapie Berlin. Eine bereits etablierte Next Generation Sequencing (NGS)-basierte Diagnostikplattform zum Nachweis neuer kardiotroper Erreger soll hierbei um den Nachweis (i) viraler Transkripte und (ii) klinisch relevanter Virusvarianten mittels innovativer „targeted Third Generation Sequencing“ (3GS mittels MinION) Technik erweitert werden. Zudem wird (iii) das Erregerspektrum um weitere kardiotrope Viren und Parasiten in einem metagenomischen Ansatz (mNGS) ergänzt. Der Einsatz moderner Sequenziertechnologien, wie mNGS und 3GS mittels MinION soll zu einer deutlichen Verbesserung des Patientenmanagements und der Etablierung personalisierter Therapieoptionen führen. Die neuen Diagnostikmodule werden nach Projektabschluss für eine weltweit einzigartige Diagnostik von Herzmuskelerkrankungen eingesetzt werden können.
